Vacancia por Salud Incompatible. Jurisprudencia

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I. Introducción: La Pregunta que Todo Funcionario Público se Hace

Durante años, la regla parecía clara: si la COMPIN decía que la salud de un funcionario era recuperable, no podían echarlo. El informe del órgano técnico era, según la jurisprudencia consolidada de la Corte Suprema, vinculante — un muro infranqueable. Pero en los últimos meses del año 2025 y ya entrado el 2026, ese muro ha mostrado grietas importantes.

La Corte Suprema ha dictado una serie de fallos que ponen en cuestión lo que se creía consolidado, y el debate —que nunca estuvo del todo cerrado— ha vuelto a instalarse con fuerza. Para entender bien el giro, hay que partir desde el principio.

II. El Marco Legal: Dos Figuras que se Confunden

El Estatuto Administrativo (Ley N° 18.834) distingue, en su Título VII, entre dos causales de vacancia por razones de salud que funcionan de manera radicalmente distinta.

Salud Incompatible (art. 151)

Opera cuando un funcionario ha hecho uso de licencia médica por más de seis meses, continuos o discontinuos, en los últimos dos años, sin que medie declaración de salud irrecuperable.¹ El jefe superior del servicio puede —no debe— declarar la vacancia. Es una facultad discrecional, aunque reglada. Antes de ejercerla, está obligado a solicitar a la COMPIN que evalúe al funcionario respecto de la condición de irrecuperabilidad de su salud.

Salud Irrecuperable (art. 152)

Es una figura distinta, con efectos distintos y mayor protección para el funcionario. Si se declara la salud irrecuperable, el servidor tiene un plazo de seis meses para retirarse de la Administración, durante el cual no está obligado a trabajar pero percibe íntegramente sus remuneraciones.² Solo si transcurrido ese plazo no se retira, procede la vacancia.

La doctrina académica ha sido enfática en señalar que se trata de dos instituciones jurídicas diferentes, con requisitos y fines propios. El artículo 151 busca garantizar la continuidad del servicio público frente a ausencias prolongadas; el artículo 152 protege al funcionario cuya condición de salud es definitiva e irreversible.³

Como señala la doctrina, confundir ambas figuras lleva a resultados absurdos: si la salud es recuperable no procedería el art. 151 (según el criterio judicial anterior), y si es irrecuperable procedería el art. 152. Bajo esa lógica, el artículo 151 del Estatuto Administrativo quedaría completamente sin aplicación, lo que contradice el principio elemental de que las normas deben interpretarse de manera que produzcan efectos.⁴

III. La Reforma de la Ley N° 21.050 y el Rol de la COMPIN

El 7 de diciembre de 2017 se publicó la Ley N° 21.050, que en su artículo 63 incorporó un tercer inciso al artículo 151 del Estatuto Administrativo. Esta modificación —aparentemente sencilla— desencadenó una de las disputas interpretativas más importantes del derecho funcionario de los últimos años.⁵

El nuevo inciso señala que el jefe superior del servicio, para ejercer la facultad señalada en el inciso primero, deberá requerir previamente a la COMPIN la evaluación del funcionario respecto a la condición de irrecuperabilidad de su salud y que no le permite desempeñar el cargo. La norma exige que la COMPIN evalúe la irrecuperabilidad. No la incompatibilidad. No si la persona puede o no puede trabajar en ese cargo específico. Solo si su salud es o no recuperable. Este detalle textual es el nudo gordiano de toda la controversia.

La historia fidedigna de la ley no indica expresamente que el informe tenga carácter vinculante. El artículo 38 de la Ley N° 19.880 (Ley de Bases de Procedimientos Administrativos) establece la regla general: "Salvo disposición expresa en contrario, los informes serán facultativos y no vinculantes".⁶ En ninguna parte del inciso tercero del artículo 151 se señala que el pronunciamiento de la COMPIN obligue al servicio.

IV. El Criterio Dominante Hasta 2024: El Informe Como Escudo Infranqueable

Pese a los argumentos de texto, la Corte Suprema adoptó desde temprano una postura proteccionista del funcionario, construyendo una doctrina que elevó el informe de la COMPIN a la categoría de acto vinculante.

1. El Informe COMPIN como Trámite Esencial y Vinculante

A partir de los fallos dictados en causas Rol N° 36.711-2021 y Rol N° 38.135-2021, la Corte Suprema estableció que "la intención del legislador, al momento de establecerse la obligatoriedad del informe previo de la COMPIN, fue que un organismo técnico estudiara los antecedentes del funcionario, a fin de determinar si su salud resulta o no recuperable, pronunciamiento que, al emanar del órgano administrativo competente al efecto, resulta vinculante para el servicio público y, en este sentido, de declararse que la salud es recuperable, no es posible aplicar la causal del artículo 151 del Estatuto Administrativo".⁷

2. La "Interdicción" de la Potestad

El Rol N° 244221-2023 introdujo un concepto de gran fuerza expresiva: el de interdicción. Si la COMPIN emite un pronunciamiento favorable al funcionario, la potestad del jefe de servicio para declarar la vacancia queda "interdicta", es decir, legalmente prohibida de manera absoluta.⁸ No se trata de que el administrador deba ponderar el informe, sino de que su facultad queda directamente extinguida para ese caso concreto.

3. El Requisito Copulativo: Irrecuperable E Incompatible

El fallo Rol N° 154393-2023 sintetizó la doctrina en su formulación más exigente: para que proceda la vacancia, el informe de la COMPIN debe expresar copulativamente que la salud del funcionario es irrecuperable e incompatible con el desempeño del cargo.⁹ Esto creaba un "mecanismo de doble cierre": si COMPIN declara salud recuperable, vacancia improcedente; si declara irrecuperable pero compatible, también improcedente; solo si dictamina irrecuperable e incompatible, queda habilitada la autoridad.

4. La Vulneración de Derechos Fundamentales

La causa Rol N° 39.898-2022 conectó el incumplimiento de este estándar con la afectación de garantías constitucionales: el derecho a la igualdad ante la ley (art. 19 N° 2 CPR) y el derecho de propiedad sobre el cargo (art. 19 N° 24 CPR).¹⁰ Esto permitía fundar recursos de protección directamente en garantías constitucionales, con la consiguiente orden de reincorporación y pago de remuneraciones devengadas.

5. El Deber de Fundamentación

La causa Rol N° 54.059-2024 reafirmó que todo acto administrativo discrecional debe estar debidamente motivado, y que la sola acumulación de días de licencia no constituye fundamento suficiente para la declaración de vacancia.¹¹ La autoridad debe expresar, en el acto mismo, los hechos y el derecho que justifican su decisión.

V. La Postura Discrepante: Contraloría y Doctrina Académica

Mientras la Corte Suprema construía este robusto edificio proteccionista, la Contraloría General de la República mantuvo una postura diferente y más conservadora respecto al texto de la ley.

El Dictamen N° 17.351 de 2018 fue el primero en fijar el criterio del ente contralor: el informe de la COMPIN es un antecedente técnico que la autoridad debe tener a la vista, pero no tiene carácter vinculante.¹² La reforma de la Ley N° 21.050 introdujo la obligación de solicitar el informe, pero no transfirió la potestad decisoria al órgano médico.

El Dictamen N° E188441 de 22 de febrero de 2022 fue aún más explícito: "la modificación legal que introdujo la exigencia de solicitar a la COMPIN la evaluación de los funcionarios con más de seis meses de licencia, no suprimió la facultad de la autoridad para declarar vacante el cargo por salud incompatible si aquel organismo concluye que la salud es recuperable".¹³

La doctrina académica (Valenzuela Concha, 2023) concluye que la interpretación de la Corte Suprema tiene el efecto paradojal de vaciar de contenido al artículo 151, pues hace imposible su aplicación en cualquier escenario. Una norma que nunca puede aplicarse es una norma que el legislador jamás debió haber dictado.¹⁴

VI. El Giro: Los Fallos de 2025 y 2026

El año 2025 marcó un punto de inflexión. Una serie de fallos de la Corte Suprema ha comenzado a apartarse de la doctrina anterior y a alinearse —con matices importantes— con la tesis de la Contraloría y la doctrina crítica.

Rol N° 11.838-2025 (25 de noviembre de 2025)

Este fallo es el primero y quizás el más significativo del giro. La Corte revocó la sentencia de la Corte de Apelaciones y rechazó el recurso de protección, validando la vacancia de una funcionaria municipal cuya salud había sido calificada como recuperable por la COMPIN.¹⁵ El razonamiento central: las figuras de salud irrecuperable y salud incompatible son jurídicamente distintas y el informe COMPIN no vincula la decisión sobre incompatibilidad.

Rol N° 38.512-2025 (27 de enero de 2026)

La Corte Suprema confirmó la vacancia de una funcionaria universitaria que había acumulado más de 240 días de licencias médicas en dos años, a pesar de que la COMPIN calificó su salud como recuperable.¹⁶ El fallo cita expresamente el Dictamen N° E188441-2022 de la Contraloría, reconociendo que el ente fiscalizador siempre sostuvo que el informe de la COMPIN no era vinculante.

Rol N° 22.195-2025 (23 de febrero de 2026)

La Tercera Sala confirmó la sentencia de la Corte de Apelaciones de Santiago que rechazó el recurso de protección interpuesto contra la Resolución TRA N° 870/1/2024.¹⁷ Señaló que la reforma de la Ley N° 21.050 no eliminó la facultad discrecional del jefe de servicio para declarar la vacancia por salud incompatible. El informe técnico permite distinguir entre recuperabilidad e irrecuperabilidad, pero no impide que la condición médica resulte objetivamente incompatible con el ejercicio continuado del cargo si se configura el presupuesto temporal.

Rol N° 8.567-2026 (18 de marzo de 2026)

La Tercera Sala confirmó la vacancia dictada por el Servicio Agrícola y Ganadero (SAG) respecto de una funcionaria a contrata, pese a que la COMPIN había declarado su salud como recuperable.¹⁸ El fallo se apoya en los dictámenes de la Contraloría N° E188441/2022 y N° 17.351/2018 y reitera que la exigencia de requerir informe de la COMPIN tiene por objeto determinar la recuperabilidad, pero no limita la facultad de la autoridad para calificar la incompatibilidad.

VII. El Criterio Anterior Sobrevive: La Jurisprudencia No Es Uniforme

Sería un error concluir que la antigua doctrina está completamente superada. En paralelo a los fallos que avalan el nuevo criterio, los tribunales —incluyendo la propia Corte Suprema— siguen pronunciando sentencias donde se ordena la reincorporación del funcionario, especialmente cuando la autoridad no acredita suficientemente la fundamentación del acto.

En octubre de 2025, la Corte Suprema (Rol N° 26.148-2025) revocó la sentencia de la Corte de Apelaciones de Valparaíso y ordenó la reincorporación de una funcionaria de la Municipalidad de La Cruz, señalando que "la recurrida actuó de manera arbitraria al declarar la vacancia del cargo, sin ponderar que la COMPIN había declarado que la salud de la funcionaria era recuperable".¹⁹

En la Corte de Apelaciones de Concepción (2026), en el caso del Servicio de Salud Arauco, el tribunal reconoció el nuevo criterio que permite declarar la incompatibilidad aunque la salud sea recuperable, pero igualmente ordenó la reincorporación porque la autoridad procedió "de manera automática y meramente cuantitativa, ignorando antecedentes críticos", lo que tornó el acto arbitrario.²⁰

VIII. Tabla Jurisprudencial Comparada

Causa / Rol	Fecha	Resultado	Criterio Central
Rol 38.135-2021	Ago 2021	Reincorporación	Informe vinculante; recuperable = impide vacancia
Rol 39.898-2022	2022	Reincorporación	Vacancia contra informe = vulnera DDFF
Rol 242612-2023	2023	Reincorporación	Carácter vinculante del dictamen COMPIN
Rol 154393-2023	2023	Reincorporación	Requisito copulativo: irrecuperable e incompatible
Rol 244221-2023	2023	Reincorporación	Interdicción de la potestad
Rol 54059-2024	2024	Reincorporación	Deber de fundamentación; no basta cómputo de licencias
Rol 26148-2025	Oct 2025	Reincorporación	Arbitrario no ponderar informe recuperable
Rol 11838-2025 (*)	Nov 2025	Mantiene vacancia	Nuevo: recuperable ≠ impide incompatibilidad
Rol 38512-2025 (*)	Ene 2026	Mantiene vacancia	Cita Dict. E188441-2022; informe no vinculante
Rol 22195-2025 (*)	Feb 2026	Mantiene vacancia	Ley 21.050 no suprimió facultad discrecional
Rol 8567-2026 (*)	Mar 2026	Mantiene vacancia	SAG; informe solo para recuperabilidad

(*) Fallos del nuevo criterio. Todos con al menos un voto en contra.

IX. El Núcleo del Debate Doctrinal

La disputa entre el criterio anterior y el nuevo puede sintetizarse en dos preguntas que los tribunales responden de manera opuesta:

¿Para qué exige la ley el informe de la COMPIN? La doctrina anterior respondía: para proteger al funcionario de una decisión arbitraria del jefe de servicio, quien no tiene experticia médica. La doctrina nueva responde: para que el jefe de servicio sepa si debe aplicar el art. 151 o el art. 152; el informe distingue entre las dos causales, pero no obliga al resultado cuando la salud es recuperable.

¿Puede aplicarse el art. 151 cuando la salud es recuperable? La postura anterior decía que no, porque una salud recuperable es compatible con el cargo a futuro. La postura nueva dice que sí, porque la incompatibilidad no es un juicio sobre el futuro sino sobre la situación presente: el funcionario no ha podido desempeñar su cargo por más de seis meses, afectando la continuidad del servicio, con independencia de que se recupere a largo plazo.

X. Implicancias Prácticas

Para Funcionarios y sus Defensores

• Verificar la fundamentación del acto: incluso bajo el nuevo criterio, la autoridad está obligada a fundamentar su resolución con antecedentes objetivos y específicos. No basta el mero cómputo de licencias.²¹

• Circunstancias del ausentismo: existen fallos donde los tribunales han ordenado la reincorporación considerando que el exceso de licencias se debió a ineficiencia del Estado.

• Verificar el cómputo de las licencias: no todas las licencias se computan. Las originadas en accidentes de servicio, enfermedades laborales y las vinculadas a la maternidad deben excluirse.

• Monitorear la evolución: dado que los fallos del nuevo criterio se adoptan con votos disidentes relevantes, la tendencia no es irreversible.

Para Jefes de Servicio y Asesorías Jurídicas

• El informe COMPIN sigue siendo trámite previo obligatorio e ineludible. Su omisión vicia de nulidad el acto de vacancia, cualquiera sea el criterio que se aplique.²²

• Aunque el informe de recuperabilidad no impide la declaración de incompatibilidad, la resolución debe fundarse adecuadamente, indicando las circunstancias específicas que hacen inviable la continuidad del vínculo.

• Si la COMPIN declara la salud como irrecuperable, el camino correcto es el art. 152, no el art. 151.

XI. Reflexión Final: Un Criterio en Construcción

Lo que está ocurriendo en la jurisprudencia de la Corte Suprema no es un giro definitivo y unánime. Es un proceso de reajuste interpretativo que coexiste, por ahora, con fallos que aún aplican la doctrina anterior. La tensión entre la protección del funcionario (principio de estabilidad en el empleo) y la continuidad del servicio público (principio de servicialidad) está lejos de resolverse de manera definitiva.

El mérito del nuevo criterio es que restaura la coherencia del sistema normativo, impidiendo que el artículo 151 del Estatuto Administrativo sea una norma muerta. El mérito del criterio anterior era proteger al funcionario de decisiones arbitrarias de autoridades sin competencia médica.

La síntesis más razonable —y que algunos fallos están comenzando a articular— puede estar en reconocer que la facultad existe aunque el informe diga que la salud es recuperable, pero exigir que la autoridad fundamente con rigor por qué la situación de ese funcionario concreto justifica el cese. No una declaración automática por el solo paso del tiempo, sino un acto genuinamente motivado.

La batalla jurisprudencial no ha terminado. Para quien litiga en esta materia, cada caso sigue siendo una oportunidad.

NOTAS

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1. No se computan para el umbral de seis meses las licencias otorgadas por accidentes de servicio, enfermedades laborales (art. 115 EA) ni las vinculadas a la maternidad y protección de la vida familiar (Título II, Libro II, Código del Trabajo).

2. La norma análoga para los funcionarios municipales se incorporó en el artículo 148 de la Ley N° 18.883 (Estatuto Municipal).

3. Valenzuela Concha, Andrés. "Declaración de salud incompatible en el Estatuto Administrativo". Revista de Derecho Público N° 99, 2023. Universidad de Chile.

4. El Tribunal Constitucional, en sentencia Rol 2.024-2012, también había señalado que el fundamento de la causal de salud incompatible radica en que el Estado no puede cesar ni suspender su actividad de satisfacción de necesidades públicas.

5. La misma reforma incorporó el inciso equivalente en el art. 148 de la Ley N° 18.883 para los funcionarios municipales.

6. Art. 38, Ley N° 19.880, de Bases de los Procedimientos Administrativos que rigen los actos de los Órganos de la Administración del Estado.

7. CS, Roles N° 36.711-2021 y N° 38.135-2021. Este criterio fue reiterado en los Roles N° 242612-2023 y N° 154604-2023.

8. CS, Rol N° 244221-2023. La Corte también calificó el informe COMPIN como "acto administrativo que se encuentra firme", con efectos análogos a la cosa juzgada administrativa.

9. CS, Rol N° 154393-2023: "la interpretación que permite la procedencia de la vacancia por salud incompatible exige que el informe técnico de la COMPIN exprese que la salud del funcionario es irrecuperable e incompatible con el desempeño, y la ausencia de ese fundamento hace improcedente cualquier cese laboral".

10. CS, Rol N° 39.898-2022: "fluye la ilegalidad de la actuación del recurrido, puesto que se declaró terminado el vínculo estatutario sin cumplir con el presupuesto legal referido, todo lo cual se traduce en una vulneración de los derechos fundamentales de la recurrente".

11. CS, Rol N° 54.059-2024: "la autoridad debe ser especialmente diligente en la fundamentación del ejercicio de una potestad discrecional, lo que no por ello se encuentra exenta del control jurisdiccional cuando la misma se ha ejercido al margen de la legalidad o de manera arbitraria".

12. Contraloría General de la República, Dictamen N° 17.351, de 11 de julio de 2018.

13. Contraloría General de la República, Dictamen N° E188441, de 22 de febrero de 2022. Este dictamen fue expresamente citado por la Corte Suprema en el fallo Rol N° 38.512-2025.

14. Valenzuela Concha, Andrés. Op. cit.

15. CS, Rol N° 11.838-2025, de 25 de noviembre de 2025. Voto en contra: ministro Contreras y abogado integrante Valdivia, quienes sostuvieron que la autoridad debía justificar la incompatibilidad concreta con las funciones.

16. CS, Rol N° 38.512-2025, de 27 de enero de 2026. La decisión se adoptó con un voto en contra, lo que refleja que el debate interno sigue vivo.

17. CS, Rol N° 22.195-2025, de 23 de febrero de 2026.

18. CS, Rol N° 8.567-2026, de 18 de marzo de 2026. Voto en contra de una abogada integrante que sostuvo que la declaración de salud recuperable impedía aplicar la causal de incompatibilidad.

19. CS, Rol N° 26.148-2025, de octubre de 2025. Este fallo es prácticamente contemporáneo con el Rol 11.838-2025, que apuntaba en sentido contrario.

20. Corte de Apelaciones de Concepción, causa relativa al Servicio de Salud Arauco, 2026.

21. Si el decreto o resolución de vacancia es escueto y automático, existe argumento sólido de arbitrariedad. Véanse CS, Rol N° 54.059-2024 y Corte de Apelaciones de Concepción, 2026.

22. Criterio unánime en toda la jurisprudencia analizada, tanto bajo el criterio anterior como el nuevo.

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